COMBINE-lab /salmon
🐟 🍣 🍱 利用选择性比对实现RNA测序读段的高度准确且极快的转录本级定量
Rust944
rna-seq-quantification 开源项目推荐（6 个）
rna-seq-quantification 话题在 GitHub 上没有填写简介，这里按 Star 数汇总最相关的热门仓库。
6收录项目
988Star 总量
4覆盖语言
相关标签
热门项目 全部 6
GitHub 共 6 个仓库，已全部展示
AlexsLemonade /scpca-nf
scpca-nf is the Nextflow workflow for processing Single-cell Pediatric Cancer Atlas Portal data
R20
Arnaroo /INDEGRA
Accurate, easy and integrated suit to compare RNA samples with different degradation levels, quantify decay rates per-transcript and correct for degradation-induced artifacts in differential gene/transcript comparisons
Python9
chi-0828 /RNA-Abundance-Quantification-on-UPMEM
Running state-of-the-art RNA-seq abundance quantification software "kallisto" on UPMEM DPU system
C7
chi-0828 /UpPipe
UpPipe is an RNA abundance quantification design on a real processing-near-memory system (UPMEM DPU); the paper of this project is published in Design Automation Conference (DAC) 2023
C7
lizetafo /rnaseq-shiny-app
R Shiny app for bulk RNA-seq: DESeq2 differential expression, gene annotation, volcano plots, heatmaps and downloadable results. Validated against DESeq2.
R1
关于这个话题
- 清单取自 GitHub 话题页并按 Star 数排序，每次展示前 6 个项目；原始页面见 https://github.com/topics/rna-seq-quantification。
- 该话题在 GitHub 上共有 6 个仓库， 本站收录的是其中最热门的 6 个，不是全量列表。
- Star / Fork 每日自动刷新一次，实时数据以 GitHub 为准。
- 当前 6 个项目累计 988 Star，覆盖 4 种主要语言，数据更新于 2026-11-10。
- 中文介绍来自 GitHub 官方话题说明（github/explore）的机器翻译，可点「查看原文」对照；译文缺失时会先展示原文。