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Pysam是一个用于读取、处理以及写入基因组数据的Python软件包，支持SAM/BAM/CRAM文件以及VCF/BCF文件的读写操作。它实际上是HTSlib API的轻量级封装版本，而HTSlib API正是samtools、bcftools和tabix等工具的底层接口。
这些Python库适用于同态加密场景，能够支持在Python中进行诸如求和、乘法、标量积或矩阵乘法等加密计算操作，同时具备与NumPy的兼容性。这些库采用SEAL/PALISADE作为后端实现，且通过Cython语言进行编译实现。
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