项目介绍

broadinstitute/gatk-sv 是一个托管在 GitHub 上的开源项目,主要使用 Python 编写,采用 BSD 3-Clause "New" or "Revised" License 许可证,目前获得 210 个 Star、84 次 Fork。

仓库全名
broadinstitute/gatk-sv

README 摘要

GATK-SV A structural variation discovery pipeline for Illumina short-read whole-genome sequencing (WGS) data. For technical documentation on GATK-SV, including how to run the pipeline, please refer to our website. Repository structure /.github: Continuous integration (CI) and continuous delivery (CD) workflows /dockerfiles: Resources for building pipeline Docker images /inputs: Files for generating workflow inputs…

完整内容见 GitHub 原始 README 或本页 。

常见问题

gatk-sv 用什么语言开发?

主要使用 Python 编写,采用 BSD 3-Clause "New" or "Revised" License 许可证,目前有 210 个 Star。

gatk-sv 可以免费商用吗?

仓库采用 BSD 3-Clause "New" or "Revised" License 许可证,可免费使用与修改,商业使用请遵守许可证条款(例如保留版权声明与许可声明)。

如何获取 gatk-sv 的源码?

可以直接克隆仓库:git clone https://github.com/broadinstitute/gatk-sv.git,默认分支为 main;安装与运行步骤见仓库 README。

gatk-sv 最近还在维护吗?

仓库最近一次更新为 1 周前,当前有 101 个未关闭 Issue;Star 数为 210,可作为社区活跃度的参考。

关于

GitHub 原始描述(英文)

A structural variation pipeline for short-read sequencing

描述取自 GitHub 官方 API,保持仓库作者书写的原文。

简要分析

热度分
389
价值分
147
活跃状态
活跃

语言占比

CSS
Cython
Dockerfile
Go Template
Java
JavaScript
Jupyter Notebook
Python
R
Shell
WDL

Release