ImageJMacro_Introduction

Supplementary for my ImageJ Tutorial

ImageJ 函数和宏用于处理热成像文件

Fiji pipeline for automated serial section reconstruction and mouse brain analysis.

微型X射线计算机断层扫描（microCT）图像分析提供了关于微观结构和性质的信息，这些对生物和地球科学领域至关重要。microCT的最新进展部分得益于新三维图像处理技术的出现。这些技术虽然是为生物/生命科学开发的，但如果有合适的应用，也有潜力支持其他科学领域。例如，微CT分析可以提供有关有孔虫微化石壳体密度和结构的信息，这些壳体常用于古海洋学，以重建海洋和气候的各个方面。关于有孔虫壳体密度和结构的信息对于表征海洋酸化变化以及有孔虫物种分类和基于群落的海表温度研究非常有用。这里展示的宏为用户友好的半自动化工作流程提供了应用imageJ/Fiji工具，提取大量个体在批量扫描中提取microCT来源的信息。所提供的示例数据集是一批单独的有孔虫壳。为简化示例，批次规模较小（六个个体），但工作流程适用于快速处理大批量（数十到数百个体）。

automated muscle histology analysis using machine learning algorithm utilizing FIJI/Image J software

SynapTrack is an automated Fiji/ImageJ pipeline for quantifying synaptic contacts in neuronal cultures and tissue sections. Built on the SynQuant segmentation engine, it performs fully unsupervised detection and quantification of synaptic puncta from fluorescence image sets that include nuclei, dendrites and pre- and postsynaptic markers

通过从零复刻你最喜欢的技术来精通编程。

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